โดยกฎจะใช้ระบบ เหย้า-เยือน รวมเอาผล 2 นัด เพื่อหาทีมผ่านเข้าไปเล่นในรอบเพลย์-ออฟต่อไป ทีมซ้ายมือจะเป็นเจ้าบ้านในเกม เลก 1 แข่งวันที่ 27 กรกฎาคม ทีมขวามือจะเป็นเจ้าบ้านในเกม เลก 2 แข่งวันที่ 3 สิงหาคม นี้
มลาด้า โบเลสลาฟ (เช็ก) – สเคนเดอร์บู (แอลเบเนีย)
โอลิมปิก โดเน็ตส์ค (ยูเครน) – PAOK (กรีซ)
ตราไค (ลิทัวเนีย) – สเคนดิย่า (มาเซโดเนีย)
ซูดูวา (ลิทัวเนีย) – ซิยง (สวิสเซอร์แลนด์)
PSV ไอนด์โฮเฟ่น (เนเธอร์แลนด์ส) – โอซิเย็ค (โครเอเชีย)
อูเทร็คท์ (เนเธอร์แลนด์ส) – เลซ พอซนัน (โปแลนด์)
สตวร์ม กราซ (ออสเตรีย) – เฟเนร์บาห์เช่ (ตุรกี)
AIK โซลน่า (สวีเดน) – บราก้า (โปรตุเกส)
AEK ลาร์นาก้า (ไซปรัส) – ดินาโม มินส์ค (เบลารุส)
ออสเตอร์ซุนด์ (สวีเดน) – โฟล่า (ลักเซมเบิร์ก)
คราสโนดาร์ (รัสเซีย) – ลิงบี้ (เดนมาร์ก)
อาสตร้า (โรมาเนีย) – อเล็กซานเดรีย (ยูเครน)
โบเตฟ พลอฟดิฟ (บัลแกเรีย) – มาริติโม่ (โปรตุเกส)
ดินาโม บูคาเรสต์ (โรมาเนีย) – แอธเลติก บิลเบา (สเปน)
เยฮูดา (อิสราเอล) – เซนิต ปีเตอร์สเบิร์ก (รัสเซีย)
อาร์ก้า กดิเนีย (โปแลนด์) – มิดทิลแลนด์ (เดนมาร์ก)
บรอนด์บี้ (เดนมาร์ก) – ไฮจ์ดุ๊ค สปลิท (โครเอเชีย)
CS U. ไครโอว่า (โรมาเนีย) – AC มิลาน (อิตาลี)
มัคคาบี้ เทล-อาวีฟ (อิสราเอล) – พานิโอนิออส (กรีซ)
บอร์กโดซ์ (ฝรั่งเศส) – วิดีโอตอน (ฮังการี)
เกนท์ (เบลเยียม) – อัลทัช (ออสเตรีย)
พานาธิไนกอส (กรีซ) – กาบาล่า (อาเซอร์ไบจาน)
FK เซอร์เวน่า ซเวซด้า (เซอร์เบีย) – สปาร์ต้า ปราก (เช็ก)
ดินาโม ซาเกร็บ (โครเอเชีย) – อ็อดด์ (นอร์เวย์)
มาร์กเซย (ฝรั่งเศส) – ออสเทนเด้ (เบลเยียม)
อเบอร์ดีน (สกอตแลนด์) – อพอลลอน (ไซปรัส)
ออสเตรีย เวียนนา (ออสเตรีย) – AEL ลิมัสโซล (ไซปรัส)
เอฟเวอร์ตัน (อังกฤษ) – รูซอมเบร็อก (สโลวาเกีย)
SC ไฟร์บวร์ก (เยอรมนี) – ดอมเซล (สโลวีเนีย)